El Convento de San Francisco fue el primero que se fundó en la provincia de Zacatecas en el año de 1567.

Después de haber fundado a mitad del Siglo XVI un hospicio originalmente ubicado en el Ex-Templo y Ex-Convento de San Agustín.

Fray Gerónimo de Mendoza, primer franciscano en llegar en Zacatecas, se estableció definitivamente en el edificio del Ex-Convento de San Francisco.

Construyéndose al igual que su Templo, en un lapso muy corto. El 7 de diciembre de 1648 se incendió el Templo.

Iniciándose la nueva construcción el 15 de marzo de 1649, terminándose por último las bóvedas y el frontispicio.

Sus religiosos fueron los misioneros encargados de evangelizar el norte de la Nueva España.

Además de otros territorios que hoy forman parte del sur de los Estados Unidos de América.

Por lo que se le conoció a Zacatecas como la \"Civilizadora del Norte\".

A raíz de la Ley de Nacionalización de Bienes Eclesiásticos en 1856, el convento entró en crisis y al aplicarse las Leyes de Reforma en 1859, el edificio empezó a deteriorarse.

El Templo siguió en uso hasta por los años de 1924 que se suspendió el culto, debido al derrumbe de las bóvedas.

En 1953 surgió la inquietud por rescatar el monumento, y fue hasta 1980 cuando se realizó una reconstrucción limitada con el afán de convertirlo en museo.

Del edificio original, sólo perduran la cúpula, la bóveda del presbiterio y la sacristía.

Este recinto de inestimable valor es uno de los más bellos del país y único en su género por la calidad de su colección de mascaras.

Actualmente alberga al Museo Rafael Coronel el cual presenta interesantes colecciones de arte popular mexicano.

Consta de cinco salas donde se exhibe la mayor colección de mascaras mexicanas de todas las épocas y estilos del país.

Donadas por el pintor zacatecano Rafael Coronel y su hijo, Juan Coronel Rivera.

Es una colección llamada el \"El rostro de México\" que está integrada por más de 10 mil máscaras mexicanas.

Usadas en danzas y ceremonias rituales de todo el país.

La colección “En tiempos de la Colonia\", colección de mil terracotas de los siglos XVII y XVIII.

La sala de la olla es otra singular muestra de una gran variedad de vasijas prehispánicas.

\"Las tandas de Rosete\" exhibe una colección de títeres del siglo XIX y principios del XX.

Además de dibujos y proyectos arquitectónicos elaborados por Diego Rivera.

Además, por supuesto se exhiben obras del propio Rafael Coronel.

En la sacristía del templo, se exhiben las Cédulas Reales y el Pendón de la Ciudad (originales).

De igual manera, en la Capilla de San Antonio se aprecia una magnífica colección de obras del autor en diferentes formatos y técnicas, algunas de las cuales se elaboraron ex profeso para ese recinto.