La flora del municipio es rica y variada dependiendo del medio geográfico, la flora más sobresaliente en el mes de junio es la flor de Xacalaxúchitl que abunda en arboles que se encuentran en barrancas.

En la parte alta de la sierra se da el pino azul verde único en la región y en el mundo ya que este solamente produce el fruto con el clima de la región llamado Maximartinenzi, el pinabete, roble, el encino, madroño y cedro arboles de madera muy estimada. En los lugares intermedios del cañón se dan en proporción el tepehuaje, el tepame, el ocote, copal, ocotillo, granero y el mimbre arboles preciados por su follaje para el ganado.

En la parte baja hay en gran abundancia el mezquite, el guamúchil, por la rivera del río se da en gran cantidad el sauz y el sabino, en explanadas y colinas el huizache y el huiscolote; en huertas el nogal, tabachín y árboles frutales de tipo mediterráneo como el naranjo, el limonero, el aguacate, la toronja, además de arboles tropicales como el mango, el plátano, el ciruelo y el granado algunos árboles como el temachaco y el guaje

La fauna del municipio es concordante con la flora. En las faldas y altos de la sierra se encuentran reptiles tales como: la lagartija, iguana, serpiente de cascabel, coralillo, sorcuate, culebra pollera.

En la parte baja de la sierra se encuentran aves canoras como el gorrión y el jilguero; de plumaje hermoso, el guacamayo; rapaces el gavilán y la aguililla; córvidos, el cuervo; de los colúmbidos, hay especies de palomas como la paloma pinta de collar, la güilota, la codorniz. A lo largo del río y en presas se encuentran bandadas de patos y de garzas.

Domésticos como el ganado vacuno, caprino, porcino, lanar y equino que influyen en la economía familiar. En variedad de peces de rio y presa, se encuentran el bagre, el boquinete, carpa, chompa entre otros; la pesca de estos peces no contribuye por la baja escala en que se practica.