En Chalchihuites existían tres iglesias importantes desde su fundación entre ellas se encuentra el dedicado a la Virgen de la Asunción.

En esos tiempos una de las velas de sebo que se usaban para alumbrar cayó al piso incendiando el templo totalmente entonces el templo se vuelve a construir.

La construcción del Templo de Nuestra Señora de las Aguas data aproximadamente para principios de 1800 y se terminó probablemente el 26 de marzo de 1816.

El templo está construido de piedra tanto su fachada como la torre, el acceso principal cuenta con elementos de herrería que es muy ornamental.

Su fachada es muy sobria y austera, donde se observan detalles de cantera muy sencillos. El bano de la entrada cuenta con arco de medio punto, su techo está conformado por bóvedas de ladrillo.

El altar es de estilo neoclásico y está dividido en un solo cuerpo con tres calles, las calles laterales son adornadas con columnas estriadas que rematan con un capitel compuesto y la central únicamente un nicho que sostiene la imagen.