Su vegetación (flora) no es muy abundante en su mayoría esta compuesta por huizache, arbol tipo mezquite, chaparro prieto, uña de gato, gobernadora, palma samandoca, epazote de zorrillo, sangre de grado, biznaga y pastizales.

La fauna de la región que ocupa el municipio de Cañitas de Felipe Pescador es rica en aves como galletera, grillo gris, paloma blanca, guilota, agachona, ganga, aguililla, gavilán, halcón, halconcillo, turco, búho, además con una gran variedad de mamíferos como ardilla, conejo, liebre, coyote, mapache, tlacuache, jabalí de collar, puma, venado cola blanca, codorniz, escamosa y zorrillo rayado.