La población que conocemos ahora como “San Miguel”, se encuentra a sólo 10 minutos de la cabecera municipal y fue donde originalmente se fundó “San Miguel de Atotonilco” en el siglo XVI.

Fue aquí donde en 1530 empieza el establecimiento y la fundación a cargo de Cristóbal de Oñate.

El agua abundante y la vegetación ayudaron al crecimiento y la importancia del establecimiento.

Es así como en menos de 10 años se iniciará la construcción de un segundo templo.

La construcción del primer Templo se da en 1530, del cual aún es posible apreciar un poco. Una fachada sencilla en cantera en la cual se distingue con claridad lo que fue la entrada principal y lo que parece ser un nicho o un ventanal.

Hacia 1538 se construye el segundo Templo, que reemplazará al primero seguramente por una cuestión de espacio.